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Text File  |  1996-03-09  |  3KB  |  47 lines
  1.        Document 0353
  2.  DOCN  M9650353
  3.  TI    Molecular analysis of human T-cell lymphotropic virus type II from Wayuu
  4.        Indians of Colombia demonstrates two subtypes of HTLV-IIb.
  5.  DT    9605
  6.  AU    Switzer WM; Owen SM; Pieniazek DA; Nerurkar VR; Duenas-Barajas E;
  7.        Heneine W; Lal RB; Retrovirus Diseases Branch, Centers for Disease
  8.        Control and; Prevention, Atlanta, Georgia 30333, USA.
  9.  SO    Virus Genes. 1995;10(2):153-62. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        GENBANK/U12795
  11.  AB    Studies of the genetic heterogeneity of human T-cell lymphotropic virus
  12.        type II (HTLV-II) have revealed the presence of two genetic subtypes,
  13.        termed HTLV-IIa and HTLV-IIb. The HTLV-IIb subtype encodes an
  14.        immunodominant epitope present at the C-terminus of the extended Tax
  15.        protein and, by using an LTR-based, restriction fragment-length
  16.        polymorphism (RFLP) assay, can be further classified into IIb60-IIb5,
  17.        with HTLV-IIb1 (Central Amerindian-like) and HTLV-IIb5 (North
  18.        Amerindian-like) being characteristic subtypes for Native American
  19.        Indians. To determine the antigenic and genetic heterogeneity among
  20.        HTLV-II-infected South Amerindians, we used a Tax synthetic peptide
  21.        immunoassay on serum, and RFLP and phylogenetic analysis on LTR
  22.        sequences amplified from genomic DNA from four Wayuu Indians of
  23.        Colombia. The Wayuu specimens displayed seroreactivity to the
  24.        immunodominant epitope located in the extended Tax region, as predicted,
  25.        and demonstrated genetic heterogeneity by the presence of both the IIB1
  26.        (Wyu1, Zuc31) and IIb5 (Wyu2, Zuc42) subtypes sequences within separate
  27.        phylogroups represented by the Guaymi Indian (IIb1) and North Amerindian
  28.        (IIb5) sequences, respectively. Sequence analysis showed that major LTR
  29.        regulatory motifs and the cis-acting repressive elements in the LTR RNA
  30.        secondary structure were relatively conserved in both Wayuu subtypes,
  31.        but the predicted secondary structure of the rex response stem loop in
  32.        the Wyu2 (IIb5) LTR sequence was 45 nucleotides (nt) and 95 nt longer
  33.        than that observed in the Wyu1 (IIb1) and G12.1 (IIb1) LTR sequences,
  34.        respectively. These results extend our knowledge of the genetic
  35.        heterogeneity of HTLV-II in South Amerindians.
  36.  DE    Amino Acid Sequence  Antigens, Viral/IMMUNOLOGY  Base Sequence  Cell
  37.        Line, Transformed  Colombia/EPIDEMIOLOGY  DNA, Viral/CHEMISTRY/GENETICS
  38.        Gene Products, tax/GENETICS  Genes, Viral  Genetic Heterogeneity  Human
  39.        HTLV-II/*CLASSIFICATION/GENETICS/IMMUNOLOGY/ISOLATION & PURIF  HTLV-II
  40.        Infections/EPIDEMIOLOGY/VIROLOGY  *Indians, South American  Molecular
  41.        Sequence Data  Nucleic Acid Conformation  Phylogeny  Repetitive
  42.        Sequences, Nucleic Acid  Serotyping  JOURNAL ARTICLE
  43.  
  44.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  45.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  46.  
  47.